随着肠道健康及防癌意识抬头，益生菌产品成为国内外保健食品市场成长最快的品类之一，然而市面上益生菌产品琳瑯满目，你真的吃对、选对了吗?有亚洲益生菌之父称谓的阳明大学专家教授，他从2005年开始推动肠道健康公益活动，就发现国人对于益生菌有许多迷思，以致不知如何选购，甚至是吃错益生菌，反而没有获得保健效果。
益生菌的8个养生功效迷思
迷思一：益生菌吃越多越好吗?
(X)【吃什么】很重要;专家表示，市面上部分宣称每份高达千亿以上菌数的产品，里面超过9成都以体积小、且容易大量培养的Enterococcus (肠球菌) 为主，真正具保健功效的如比菲德氏菌或植物乳杆菌，仅占不到10%;所以，菌数吃得多不如吃得精。以肠道消化保健而言，一天100-200亿便足够;免疫调节功能的菌也一天200亿，吃三个月可以看到效果;而特殊功能如精神心理、代谢调节等，一天要吃600亿以上。
迷思二：所有人都可以吃益生菌吗?小朋友吃会不会有问题?
说明：益生菌并没有完全零风险的保证。研究显示，不管在成年人、老人、婴幼儿与怀孕妇女等族群，使用益生菌似乎是安全的，但在部分特定的族群(例如：胰脏炎、免疫不全等)仍有潜在安全上的疑虑。
迷思三：所有益生菌都能抗过敏、预防便秘、辅助睡眠?
(X)益生菌功效应看「菌株」而非盲目选择;专家指出，乳酸菌有成千上万种，其中只有极少数对健康有益的特殊菌株，才能称为益生菌。不同的益生菌株，各自有其特殊功效，如提高精神活性、舒压助眠、抗发炎、减缓过敏等;事实上就如同维他命A、维他命B、维他命C都各自有其截然不同的生理功效，益生菌也是一样，不能因为看到都是益生菌三个字就混淆。阳明大学益生菌研究中心的菌株库中，同样是Lactobacillus plantarum (植物乳杆菌)，便分别有降低压力荷尔蒙、降低发炎指标、抑制坏菌等不同突出特性，不能说都是植物乳杆菌就都有这三种功能。
迷思四：吃了益生菌就不会便秘吗?
(X)益生菌这样吃反而会便秘!专家解释，时常在演讲场合遇到民众问为何开始吃益生菌之后，反而便秘更严重?这些民众的生活习惯时常会有水喝不够、蔬果纤维吃不够问题。因为舒缓便秘问题只靠益生菌是不够的，且市售好的益生菌产品多半会加上水溶性纤维益生质，应该大量喝水以达到更好的功效;若自认为吃了益生菌就可以不补充蔬果、喝水，反而会让便秘更严重。
迷思五：正在服用抗生素，可以吃益生菌吗?
因为益生菌相较于抗药性致病菌显得比较脆弱，正在做抗生素疗法的病患在结束疗程后再补充益生菌比较有效;如果抗生素疗程较长必需并用，建议在服用抗生素 2 小时后再行补充，益生菌可能较容易存活。
迷思六：益生菌可以治疗许多现代人的疾病?
(X)益生菌只是辅助品，不能取代正规治疗，且重症患者应小心使用;专家强调，虽然益生菌是相当安全的保健品，但益生菌只是辅助，绝对不能取代药物。例如消费者听到有可提升快乐情绪的益生菌，都会趋之若鹜，一旦精神科病人贸然在未经医师允许状况下擅自停药，这是非常危险的。此外，益生菌毕竟多半是活菌状态，重症患者或免疫力异常低下的民众，应减量或先暂停服用，并询问医师，以确保安全。
迷思七：益生菌可改善呼吸道过敏?
目前并无医学证实，益生菌能取代现行的治疗，提醒患者勿过度迷信，专家指示接受正规的医疗治疗，除此之外，日常可减少环境中的过敏原如尘螨，像利用除湿机将室内湿度控制在50~60%，寝具约2周清洗1次，皆有助减少发作。
迷思八：现代的益生菌技术成熟可以常温保存?
(X)益生菌怕热!专家说明，以实验室常规所谓的常温/室温，一般是指25度。益生菌天生就是怕高温，当温度超过30多度，活性就会快速下降，例如25度可以安定放半年，30度可能就只安定一个月，37度也许连几天也撑不了。另外，益生菌可以冷冻，但不要拿进拿出，虽然益生菌不怕冻，但怕反复的冻结溶解，在细胞里，冰晶形成又化解，最伤细胞结构，因此虽说可以冷冻，但不要进进出出。